مرحلهی سوم و آخر انتخابی جام جهانی ۲۰۱۰ در منطقهی آفریقا برگزار شد و ۲۰ تیم راهیافته به این مرحله در ۵ گروه ۴ تیمی تقسیم شدند:
گروه ۱: توگو - کامرون - مراکش - گابون
گروه ۲: موزامبیک - نیجریه - کنیا - تونس
گروه ۳: روآندا - الجزایر - مصر - زامبیا
گروه ۴: غنا - بنین - سودان - مالی
گروه ۵: ساحل عاج - مالاوی - بورکینافاسو - گینه
در پایان مرحلهی سوم 5 تیم سرگروه به جام جهانی صعود میکنند.