مرحله‌ی نیمه‌نهایی جام حذفی باشگاه‌های کشور، با حذف تیم‌های ذوب‌آهن اصفهان و صباباطری قم و صعود پرسپولیس و گسترش فولاد تبریز به فینال به پایان رسید.
این برای اولین بار در طول تاریخ جام حذفی ایران است که تیمی از لیگ دسته یک به فینال جام حذفی راه پیدا می‌کند.
مرحله‌ی نیمه‌نهایی
جمعه 3/2/1389
2-31* گسترش فولاد تبریز 2-0 ذوب‌آهن اصفهان
2-32* پرسپولیس تهران 0-0 صباباطری قم (پنالتی: پرسپولیس 4-3 صباباطری)
ضربات پنالتی:
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | |
| پرسپولیس | هوارملامحمد | مجتبی زارع | تیاگو فراگا | محسن خلیلی | شیث رضایی | کریم باقری |
| صباباطری | داوود حقی | کلمنتینو | محمد همرنگ | مرتضی اسدی | سهراب بختیاری زاده | ابوالفضل حاجی زاده |
فینال
جمعه 31/2/1389 بازی رفت
جمعه 7/3/1389 بازی برگشت
* میزبانان و میهمانان فینال متعاقباً به قید قرعه مشخض خواهند شد.